Serial jest kontynuacją filmu "Gwiezdne Wrota". Kolejne odcinki ilustrują wyprawy do innych światów przy wykorzystaniu wrót nadzorowanych przez wojskowych. Wrota działają tu w obie strony i mogą przez nie przebywać również przybysze z innych wymiarów: zarówno dobrzy, jak i siejący zagładę. Wyprawami dowodzi pułkownik O'Neil (Richard Dean Anderson).W trakcie rutynowej misji rozpoznawczej statek UAV rozbija się na planecie przypominającej kaktus. SG-1 zostaje wysłane na miejsce, aby odnaleźć szczątki frachtowca. Członkowie misji ratunkowej stają się świadkami rozprzestrzeniającej się plagi, której ofiarami padają mieszkańcy planety.